北医-生信-ecDNA的泛癌种分析



  • 研究课题:探究ecDNA在泛癌种中造成预后不良的多组学因素
    小组成员:张经纬,邓嘉铭
    研究进展:基于TCGA数据库分析了ecDNA在泛癌种当中的分布,明确了ecDNA造成预后不良的癌种,转录组学层面的DEG、GO、GSEA、GSVA分析提示ecDNA+呈现出免疫抑制的特征,免疫浸润方面还正在完善
    研究感悟:

    1. 积累起来的生信技术可以轻松快速地迁移到新的研究当中
    2. 理解原理和代码实践是一个相互促进的过程,可以先了解原理,但没必要等吃透了原理再用代码实践
    3. 经纬师兄的指引对我有非常大的帮助,大大缩短了我上手生信的周期,感谢师兄!
    4. 将生信技术结合到临床问题中去,才能进行有意义的研究,而非创造生信水文