科研碰撞试点组打卡盖楼



  • 先介绍一下我们组的成员😊 :孙佳文、张经纬、鲜昊城、孙一心、林铭浩



  • 第六次科研碰撞于2022.5.8通过腾讯会议进行,主要分享人是林铭浩和张经纬

    林铭浩:
    一、介绍了MRD的概念,及目前正在撰写的综述“MRD在血液学肿瘤诊疗方面应用”框架
    ■MRD:微小残留病灶(minimal residual disease,MRD)或可测量残留病灶(molecular residual disease,MRD):是一个源自于血液肿瘤的概念,诸如多发性骨髓瘤、急性淋巴细胞白血病等血液肿瘤患者在治疗后可通过流式细胞术、定量PCR、二代测序(NGS)等高灵敏度的检测手段对骨髓或外周血样本中可能存在的微量克隆肿瘤细胞进行检测,以评估患者治疗后体内的肿瘤残留状态。
    二、分享论文写作Tips:
    ●科研通:查找文献 https://www.ablesci.com/
    ●科研者之家 https://www.home-for-researchers.com/static/index.html#/
    ●画图工具推荐: https://app.biorender.com/
    ●昊诚补充画图工具(科研者之家平台研发):https://www.figdraw.com/static/index.html#/
    ●经伟补充画图工具:https://smart.servier.com/

    张经纬:
    一、介绍了目前进行的大创项目:基于染色体外MYC家族基因扩增预测小细胞肺癌药物敏感性的研究
    ●探讨了小细胞肺癌中是否存在ecDNA介导的MYC家族基因扩增,及其对生物学行为和药物敏感性有何影响。
    二、简述了CCK8实验检测细胞药物敏感性的原理及方法。



  • @林铭浩 这个网站在找类似文献方面超级好用!引用关系,节点文献一目了然,路过的小伙伴都可以收藏一下~



  • 第五次科研碰撞是于2022.1.9通过腾讯会议进行,主要分享人是鲜昊城和张经纬
    鲜昊城:
    经巩膜睫状体光凝术患者预后相关影响因素的分析——一项真实世界研究
    开题流程的分享
    真实世界研究指南
    可查文献相似度的网站connectedpapers.com,快速了解某领域(大家可自行探索,目前是免费的😁
    张经纬:
    空间组学在肿瘤免疫微环境中的应用
    肿瘤免疫微环境分析的发展概况
    IMC、CODEX的原理及各自优势



  • 你们组的科研实力太强了👍



  • 第四次科研是于12月19日通过腾讯会议举行,主要分享人是孙一心、孙佳文和林铭浩。
    孙一心:介绍了“circPTE1鉴定及其肿瘤生物学功能的研究”;Transwell实验;3D瘤体侵袭实验;
    孙佳文:介绍了“结直肠癌肝转移SBRT治疗预后分析”;SBRT概念
    林铭浩:介绍了“HLA B leader与造血干细胞移植预后的研究”



  • 第三次科研碰撞是于11月28日通过腾讯会议举行,主要分享人是张经纬和鲜昊城。
    张经纬:
     染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNA, ecDNA)是近来的一大研究热点,研究表明几乎所有癌种都存在ecDNA扩增的现象,ecDNA扩增的现象与耐药性、异质性和预后不良有关。
     预测ecDNA使用的生物信息学软件AmpliconArchitect
     肿瘤药物敏感数据库:GDSC https://www.cancerrxgene.org/ 收录多种药物及细胞系的IC50数据
     GSEA和GO富集的区别,可以参考https://zhuanlan.zhihu.com/p/395178020
    鲜昊城:生信网站
    http://www.ehbio.com/ImageGP/index.php/Home/Index/index.html(可以做各种图)
    http://www.easyr.cc/login(用R做临床分析)
    https://www.xiantao.love/products(付费)



  • @林铭浩 哇,我觉得我们的下下一期科研沙龙的素材有了,安排上安排上



  • 第二次科研碰撞是于11月13日通过腾讯会议举行,主要分享人是林铭浩、孙一心和孙佳文。林铭浩介绍了HLA loss在白血病复发的机制和临床后果,并提出可能的碰撞方向,如在肺癌中的研究。孙一心则分享了“Hsa_circ_0002232调节结直肠癌发生发展的分子机制”,介绍了自己的研究内容和思路,并演示了circBase网站和circPrimer应用的常规使用方法。孙佳文师姐分享了非小细胞肺癌相关的研究报告,介绍了研究设计基本的写作方法。



  • 第一次科研碰撞是于10月30日在跃进厅3楼进行,主要分享人是张经纬和鲜昊城。张经纬向大家分享了“探究胰腺癌细胞中染色体外环状 DNA 上癌基因表达的机制”课题研究,而鲜昊城则分享了“Antimetastatic Effects of Ganoderma lucidum Polysaccharide Peptide on B16-F10-luc-G5 Melanoma Mice With Sleep Fragmentation”写作历程,两人还主要介绍了分子领域常用的一些网址,如ENCODE、oncomine、depmap、metascape的使用,并向大家推荐了GraphPad Prism的应用。